I kampen for at redde Ninjago-byen tvinges den unge ninja Lloyd til at arbejde tæt sammen med sine venner, som alle er både hemmelige ninja-krigere og LEGO-mesterbyggere. Sammen med og anført af kung fu-mesteren Wu skal de besejre den ondskabsfulde krigsherre Garmadon – den værste sjover nogensinde! Men Garmadon er også Lloyds far, så i denne episke kamp mellem far og søn bliver dette udisciplinerede team testet af ninjaer, og de må lære at kontrollere deres egoer og hjælpes ad for at kunne frigøre deres egne indre styrker.